厦大物理学系是国内最早开展软物质研究的单位之一，拥有教育部柔性物质研究及应用创新引智基地（111基地）、福建省柔性功能材料重点实验室、厦门市柔性导电材料与器件工程技术研究中心、基金委理论物理交叉交流平台。主导编写《物理大百科全书》软物质、生物物理词条，审定基金委软物质关键词，协调撰写《软物质系列丛书》和《中国科学发展战略报告》软凝聚态物理学发展战略研究报告。着眼国际前沿和国家需求，致力于软凝聚态体系结构与性质关联的关键问题研究，发展适合该体系的实验技术、理论和模拟手段，在高分子与液晶等软物质系统，仿生材料与柔性器件，生物物理学与计算生物医学等方面取得突破性进展。