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物理学系“软物质系列学术报告”
报告题目:
甲基化结合蛋白MBD2和MBD3不同的 CpG甲基化依赖 行为模式
报告人:
潘海 副研究员
专家单位:
国科温州研究院
报告地点:
海韵物理楼咖啡厅机房
报告时间:
2023年3月14日(周二) 16:00
学术系列:
物理学系“软物质系列学术报告”

报告摘要: 甲基化结合蛋白2和3(MBD2和 MBD3)是为核小体重塑和脱乙酷酶(Nucleosome Remodeling and Deacetvlase,NuRD) 复合物提供结构功能和 DNA 结合能力的亚基蛋白。这两种蛋白质形成截然不同的 NuRD 复合物并显示出对甲基化 DNA不同的结合亲和力和选择性。先前的研究表明,MBD2 与单个甲基化 CpG 有很高的亲和力和选择性而 MBD3 则没有,然而NuRD 复合体在基因组中富含CpG的 区域 (CpG岛)中发挥作用。 在这项工作中,我们结合使用单分子和生物物理分析(DNA tightrope和AFM),使用具有生物学相关性的 DNA 模板 (不同CpG位点密度) 研究了MBD2 和MBD3对甲基化DNA不同的结合和扩散模式。结果表明 MBD2MBD3 均能自由快速地在富含 CpG而未甲基化的DNA上一维扩散。相反,我们发现高密度CpG 甲基化岛导致MBD2与DNA稳定、静态的结合,而 MBD3在甲基化DNA上亦能自由扩散。 此外,我们证明了两种蛋白都可以弯曲 DNA,而这种弯曲程度是甲基化依赖的。这些结果显示MBD2-NuRD 能定位并压缩甲基化CpG 岛,而MBD3-NURD 可以独立于DNA甲基化程度将核小体自由定位。

 

主讲人:2012年于南京大学取得理学博士学位,先后于南京大学生物物理研究所和北卡州立大学物理系从事博士后工作,开展单分子生物物理研究。2021年底加入中国科学院大学温州研究院曹毅教授课题组。主要使用smFRET技术研究蛋白质及DNA构型变化动力学。曾在NucleicAcids Research.JBC, Langmuir等期刊发表的论文数篇。


报告人 潘海 副研究员 专家单位 国科温州研究院
报告地点 海韵物理楼咖啡厅机房 报告时间 2023年3月14日(周二) 16:00
学术系列 物理学系“软物质系列学术报告”